Regjistri i Objekteve

Bibliografi

Lloji i Aplikimit

EPO patents

Nënlloji i Aplikimit

EPO Patent

(10) Numri dhe Data e Regjistrimit

4015 2012.07.05

Status

Regjistruar

(180) Data e mbarimit të afatit

2026.06.09

(20) Numri dhe Data e Depozitimit

AL/P/2011/3792 2011.07.20

(40) Numri dhe Data e Publikimit

2012.06.01

(86) Data dhe Numri Ndërkombëtar i Depozitimit

06784718.6 2006.06.09

Status

Regjistruar

Data dhe Numri Ndërkombëtar i Publikimit

EP1910538 2011.04.27

(30) Detajet e Prioritetit

Kodi	ID e prioritetit
US	731041
US	689466

(51) Klasat e KNP-së (IPC)

(71/73) Aplikanti

Aplikanti	Adresa
GlaxoSmithKline LLC	Corporation Service Company, 2711 Centerville Road, Suite 400, Wilmington , Delaware 19808

(72) Shpikës

Emri	Adresa
CENTRELLA, Paolo A.	612 Old Stonebrook Road Acton, MA 01720 , US
MORGAN, Barry	237 Prospect Street Franklin, MA 02038 , US
HALE, Stephen	133 Brookside Avenue Belmont, MA 02478 , US
ARICO-MUENDEL, Christopher C.	21 Shaw Street West Roxbury, MA 02132 , US
CLARK, Matthew	4 Glenn Terrace Cambridge, MA 02139 , US
KAVARANA, Malcolm J.	516 Farms Drive Burlington, MA 01803 , US
CREASER, Steffen, Phillip	47 Cottage Street, 3 Cambridge, MA 02139 , US
FRANKLIN, George J.	18 Murray Avenue Auburn, MA 01501 , US
CENTRELLA, Paolo A.	, US
WAGNER, Richard	24 Coolidge Avenue Cambridge, MA 02138 , US
ISRAEL, David I.	117 Anson Road Concord, MA 01742 , US
GEFTER, Malcolm L.	46 Baker Bridge Road Lincoln, MA 01773 , US
BENJAMIN, Dennis	9929 157th Place, N.E. Apartment V-929 Redmond, WA 98052 , US
HANSEN, Nils Jakob Vest	1073 14th Street San Francisco, CA 94114 , US
ACHARYA, Raksha A.	2 Glen Ora Drive Bedford, MA 01730 , US

(74) Emri i Përfaqësuesit

Emri	Adresa
Vladimir NIKA	Bul " Bajram CURRI", Pall.2, Shk.3, Ap.4, Tiranë , AL
Krenar LOLOCI	Rr. "Dëshmorët e 4 Shkurtit", Pall. 1/1, Kati 2, Tiranë , AL
Vladimir NIKA	Bul " Bajram CURRI", Pall.2, Shk.3, Ap.4, Tiranë , AL
Krenar LOLOCI	Rr. "Dëshmorët e 4 Shkurtit", Pall. 1/1, Kati 2, Tiranë , AL

(54) Titull

METODAT PER SINTEZEN E LIBRARIVE TE KODUARA

(57) Abstrakt

(58) Pretendime

Pretendim	Përshkrim
1	Një metodë për sintetizimin e një molekule e përbërë nga një pjesë funksionale që është e lidhur në mënyrë operative tek një oligonukleotid i koduar i cili identifikon strukturën e një pjesë funksionale, metoda në fjalë përbëhet nga hapat si: (a) marrja e një përbërje fillestare që konsiston në një pjesë funksionale fillestare e përbërë nga n blloqe të ndërtuara, ku n është një numër i plotë i 1-it ose më i madh, ku pjesa funksionale fillestare përbëhet nga të paktën një grup reaktiv, dhe është e lidhur në mënyrë operative tek një oligonukleotid fillestar; ku pjesa funksionale fillestare dhe oligonukleotidi fillestar janë lidhur përmes një pjese lidhëse dhe ku oligonukleotidi fillestar është bërë dy hërë shirit dhe pjesa lidhëse është iftuar në mënyrë kovalente tek pjesa funksionale fillestare dhe tek të dy shiritat e oligonukleotidit fillestar; (b) veprimi i përbërjes fillestare me një bllok të dëshiruar të ndërtuar që përbëhet nga të paktën një grup reaktiv plotësues, ku të paktën njëri nga grupet reaktiv plotësues është plotësues ndaj grupit reaktiv të hapit (a), në kushte të përshtatshme për veprimin e grupit reaktiv plotësues për formimin e një lidhje kovalente; (c) veprimi i oligonukleotidit fillestar me një oligonukleotid hyrës që identifikon bllokun e ndërtuar të hapit (b) në prani të një enzime e cila katalizon lidhjen e oligonukleotidës fillestare dhe të oligonukleotidës hyrëse, në kushte të përshtatshme për lidhjen e oligonukleotidës hyrëse dhe të oligonukleotidës fillestare për formimin e një oligonukleotidi të koduar, ku fundi i oligonukleotideve hyrëse në fjalë përbëhet nga një sekuencë mbyllëse, sekuenca mbyllëse në fjalë përbëhet nga një sekuencë nukleotide që përmban nukleotide të degraduara; duke prodhuar në këtë mënyrë një molekule e cila përbëhet nga një pjesë funksionale e përbërë nga n+1 blloqe të ndërtuara që është e lidhur në mënyrë operative tek një oligonukleotid i koduar i cili identifikon strukturën e pjesës funksionale.
2	Një metodë për sintetizimin e librarive të përbërjeve, ku përbërjet përbëhen nga një pjesë funksionale e cila përbëhet nga dy ose më shumë blloqe të ndërtuara që është e lidhur në mënyrë operative tek një oligonukleotid i koduar i cili identifikon strukturën e pjesës funksionale, metoda në fjalë përbëhet nga hapat si: (a) marrja e një tretësi që përbëhet nga përbërjet fillestare m të pretendimit 1, ku m është një numër i plotë i 1-it ose më i madh;(b) veҫimi i tretësit të hapit (a) në enët vepruese r, ku r është një numër i poltë i 2-it ose më madh, duke prodhuar kështu r alikuota të tretësit; (c) veprimi i përbërjeve fillestare në ҫdo enë vepruese me një prej r blloqeve të ndërtuara, blloqet e ndërtuara në fjalë përbëhen nga të paktën një grup reaktiv plotësues, ku të paktën njëri nga grupet reaktiv plotësues është plotësues ndaj grupit reaktiv të hapit (a), në kushte të përshtatshme për veprimin e grupit reaktiv plotësues për formimin e një lidhje kovalente, duke prodhuar kështu r alikuota të përbërjeve përbërëse që konsistojnë në një pjesë funksionale të përbërë nga blloet e ndërtuara n+1 të lidhura në mënyrë operative ndaj oligonukleotideve fillestare; dhe (d) veprimi i oligonukleotideve fillestare në secilën alikuotë me një të një seti prej r oligonukleotidesh hyrëse dalluese që i korrespondojnë bllokut të ndërtuar të hapit (c) në prani të një enzime që katalizon lidhjen e oligonukleotidit hyrës dhe të oligonukleotidit fillestar, në kushte të përshtatshme për lidhjen enzimatike të oligonukleotidit hyrës dhe të oligonukleotidit fillestar për formimin e një oligonukleotidi të koduar, ku fundi i oligonukleotideve hyrëse dalluese r në fjalë përbëhet nga një sekuencë mbyllëse, sekuenca mbyllëse në fjalë përbëhet nga një sekuencë nukleotide që përmban nukleotide të degraduara; duke prodhuar në këtë mënyrë r alikuota që përbëhen nga molekula të cilat konsistojnë në një pjesë funksionale që përbëhet nga n+1 blloqe të ndërtuara të lidhura në mënyrë operative ndaj një oligonukleotidi të koduar i cili identifikon strukturën e pjesës funksionale që përbëhet nga n+1 blloqe të ndërtuara,
3	Metoda e Pretendimit 1 ku pjesa funksionale e hapit (c) përbëhet nga një grup reaktiv, dhe hapat nga (a) deri në (c) përsëriten një ose disa herë, duke formuar në këtë mënyrë ciklet 1 deri në i, ku i është një numër i plotë i 2-it ose më i madh, ku produkti i hapit (c) i një cikli s, ku s është një numër i plotë i i-1ose më pak, është përbërja fillestare e ciklit s + 1.
4	Metoda e Pretendimit 1 ku hapi (c) i paraprin hapit (b) ose hapi (b) i paraprin hapit (c).
5	Metoda e Pretendimit 1 ku të paktën një nga blloqet e ndërtuara është një amino acid ose një amino acid i aktivizuar.
6	Metoda e Pretendimit 1, ku enzima është përzgjedhur nga grupi që konsiston në një ADN ligazë (Trans. note: ҫdonjëra nga klasat e enzimave që katalizon lidhjen e dy molekulave, duke përdorur zakonisht një ATP si një donator energjie) një RNA ligazë, një ADN polimerzë, një RNA polimerazë dhe një topoizomerazë.
7	Metoda e Pretendimit 1 ku oligonukleotidi fillestar përbëhet nga një sekuencë primere PCR.
8	Metoda e Pretendimit 1 ku oligonukleotidi hyrës ka një gjatësi prej 3 deri në 10 nukleotide.
9	Metoda e Pretendimit 3, përbëhet më tej pas ciklit i, nga hapi (e) që ciklizon pjesën funksionale; opsionalisht ku pjesa funksioale përbëhet nga një grup alkinil dhe një grup azido, dhe përbërja i nënshtrohet kushteve të përshtatshme për ciklo-shtimin e grupit alkinil dhe grupin azido për të formuar një grup triazol, duke ciklizuar në këtë mënyrë pjesën funksionale.
10	Metoda e Pretendimit 2, përbëhet më tej nga hapi (e) që kombinon dy ose më shumë të alikuotave r, duke prodhuar në këtë mënyrë një tretësirë të përbërë nga molekula që konsistojnë në një pjesë funksionale që përbëhet nga n+1 blloqe të ndërtuara, e cila është e lidhur në mënyrë operative ndaj një oligonukleotidi të koduar i cili identifikon strukturën e pjesës funksionale që përbëhet nga n+1 blloqe të ndërtuara.
11	Metoda e Pretendimit 10 ku alikuotat r janë të kombinuara.
12	Metoda e Pretendimit 10 ku hapat nga (a) deri në (e) janë kryer një ose disa herë për të prodhuar ciklet nga 1 në i, ku i është nje numër i plotë i 2-it ose më i madh, ku në ciklet s+1, ku s është një numër i plotë i i-1 ose më pak, tretësira përbëhet nga përbërjet fillestare m të hapit (a) është tretësira e hapit (e) e ciklit s, opsionalisht ku në të paktën njërin nga ciklet I në i të hapit (d) i paraprin hapit (c).
13	Metoda e Pretendimit 1, ku pjesa lidhëse përbëhet nga një grup i parë funksional i përshtatur që të lidhet me një bllok të ndërtuar, një grup të dytë funksional i përshtatur që të lidhet tek fundi 5’ i një oligonukleotidi, dhe një grup i tretë funksional i përshtatur që të lidhet tek fundi – 3’ i një oligonukleotidi.
14	Metoda e Pretendimit 13 ku pjesa lidhëse është e strukturës ku A është një grup funksional i përshtatur që të lidhet ndaj një blloku të ndërtuar; B është një grup funksional i përshtatur që të lidhet ndaj fundit-5’ të një oligonukleotidi; C është një grup funksional i përshtatur që të lidhet ndaj fundit-3’ të një oligonukleotidi; S është një atom ose një mbajtës; D është një strukturë kimike që lidh A-në me S-në; E është një strukturë kimike që lidh B-në me S-në; dhe F është një strukturë kimike që lidh C-në me S-në; opsionalisht ku (i) A është një grup amino; B është një grup fosfat; dhe C është një grup fosfat; ose (ii) ku D, E dhe F janë secila, në mënyrë të pavarur, një grup alkilen ose një grup oligo (etilen glikol); ose (iii) ku S është nje atom karbon, një atom azot, një atom fosfor, një atom bor, një grup fosfat, një grup ciklik ose një grup policiklik; ku opsionalisht pjesa lidhëse ështe e strukturës ku ҫdo nga n, m dhe p është, në mënyrë të pavarur, një numër i plotë nga 1 deri në rreth 20; opsionalisht (A) ku ҫdo nga n, m dhe p është në mënyrë të pavarur një numër i plotë nga 2 në tetë, ku opsionalisht ҫdo nga n, m dhe p është në mënyrë të pavarur një numër i plotë nga 3 në 6; ose (B) ku pjesa lidhëse ka strukturën
15	Metoda e Pretendimit 9, përbëhet më tej nga cikli vijues i, hapi konsiston në: (f) ciklizimin e një ose më shumë të pjesëve funksionale; opsionalisht ku një pjesë funksionale e hapit (f) përbëhet nga një grup azido dhe një grup alkinil; opsionalisht ku pjesa funksionale mbahet në kushte të përshtatshme për ciklo-shtimin e grupit azido dhe të grupit alikinil për formimin e një grupi triazol, duke formuar në këtë mënyrë një pjesë funksionale ciklike; ku opsionalisht reaksioni i ciklo-shtimit është kryer në prani të një katalizatori bakri; ku opsionalisht të paktën një nga një ose më shumë të pjesëve funksionale të hapit (f) përbëhet nga të paktën dy grupe sulfhidril, dhe pjesa funksionale në fjalë mbahet në kushte të përshtatshme për veprimin e dy grupeve sulfhidril për formimin e një grupi disulfid, duke ciklizuar në këtë mënyrë pjesën funksionale.
16	Metoda e Pretendimit 1, ku grupi reaktiv dhe grupi plotësues reaktiv janë përzgjedhur nga grupi që konsiston në: (i) një grup amino; një grup karboksil; një grup sulfonil; një grup fosfonil; një grup epoksid; një grup aziridin; dhe një grup izocianat; ose (ii) një grup hidroksil; një grup karboksil; një grup sulfonil; një grup fosfonil; një grup epoksid; një grup aziridin; dhe një grup izocianat; ose (iii) një grup amino dhe një aldehid ose grup keton, ku opsionalisht veprimi ndërmjet grupit reaktiv dhe grupit komplementar reaktiv kryhet në kushte të reduktuara; ose (iv) një grup ilid fosfor dhe një aldehid ose grup keton.
17	Metoda e Pretendimit 1 ku grupi reaktiv dhe grupi plotësues reaktiv veprojnë me anë të ciklo-shtimit për të formuar një strukturë ciklike, ku opsionalisht grupi reaktiv dhe grupi plotësues reaktiv janë përzgjedhur nga grupi që konsiston në (i) një alkin dhe një azid; ose (ii) një grup heteroaromatik i halogjenizuar dhe një nukleofil; ku opsionalisht grupi heteroaromatik i halogjenizuar është përzgjedhur nga grupi që konsiston në pirimidinet e kloronizuara, triazinet e kloronizuara dhe purinet e kloronizuara; ose ku nukleofil është një grup amino.
18	Një metodë për identifikimin e një ose më shumë përbërjeve të cilat lidhen ndaj një targeti biologjik, metoda në fjalë përbëhet nga hapat si: (a) targeti biologjik kontakton me një përbërje të librarisë të përgatitur sipas metodës të Pretendimit 2 në kushte të përshtatshme që të paktën një anëtar të përbërjes së librarisë të lidhet tek targeti; (b) heqja e anëtarëve të librarisë të cilët nuk lidhen ndaj targetit; (c) amplifikimi i oligonukleotideve të koduara me të paktën një anëtar të librarisë së përbërjes e cila lidhet ndaj targetit; (d) sekuencizimi i oligonukleotideve të koduara të hapit (c); dhe (e) përdorimi i sekuencave të përcaktuara në hapin (d) për të përcaktuar strukturën e pjesëve funksionale të anëtarëve të librarisë së përbërjes të cilat lidhen ndaj targetit biologjik; duke identifikuar në këtë mënyrë një ose më shumë përbërje të cilat lidhen ndaj targetit biologjik.
19	Metoda e pretendimit 1 ose 2, ku sekuenca mbyllëse në fjalë përbëhet nga sekuenca në vijim: 3’-AAGTCGCAAGCT NNNNN GTCTGTTCGAAGTGGACG - 5’, ku N është ҫdonjëra nga A, T, G ose C.
20	Metoda e pretendimit 1 ose 2, ku sekuenca mbyllëse në fjalë përbëhet nga sekuenca në vijim: 3’- AA GTCGCAAGCTACG ABBBABBBABBBA GACTACCGCGCTCCCTCCG - 5’, ku B është ҫdonjëra nga T, G, ose C.
21	Metoda e pretendimit 1 ose 2, ku reaksionet kryhen në tretesirë.
22	Metoda e pretendimit 1 ose 2, ku molekula e sintetizuar është një përbërje polimerike.
23	Metoda e pretendimit 1 ose 2, ku molekula e sintetizuar është një përbërje jo-polimerike.